农工党遵义医学院支部成立于1995年12月7日，2003年3月，农工遵义医学院支部分为附院一支部和学校二支部。

在农工党支部发展历程中，涌现出许多代表人士，他们在参政议政、建言献策、社会服务和党派工作等方面做出了积极贡献。2001年支部被农工党中央授予“全国先进集体”光荣称号；农工党二支部被农工党省委授予2007—2008年度服务社会工作先进集体；2021年被农工党省委授予“五星支部”，被农工党市委授予“六星支部”；2010年，实验教学管理中心主任、农工党遵义市委副主委李建国主任医师，荣获中国农工民主党“社会服务先进个人”称号；2021年，农工党遵义医科大学二支部主委张博副教授，荣获中国农工民主党贵州省“基层组织先进个人”称号、荣获中国农工民主党贵州省“反映社情民意信息工作中成绩突出”表彰、荣获中国农工民主党遵义市委“党务工作先进个人”称号。

附院一支部领导班子：

主 委：陈华军

副主委：曾 炜

学校二支部领导班子：

主 委：张 博

副主委：张绍伟